TY - JOUR T1 - In Silico design and in vitro validation for siRNA targeting PTX3 gene in glioma cell line TT - طراحی in silico و تأیید in vitro برای siRNA هدف گیرنده ژن PTX3 در رده سلولی گلیوما JF - KAUMS JO - KAUMS VL - 26 IS - 1 UR - http://feyz.kaums.ac.ir/article-1-4518-fa.html Y1 - 2022 SP - 9 EP - 21 KW - PTX3 KW - Glioma KW - siRNA KW - Apoptosis KW - U-87 N2 - سابقه و هدف: شناسایی مکانیسم‌های زمینه‌ای پاتوژنز گلیوما از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. بیان بیش از حدّ ژن PTX3 عمیقاً در پاتوژنز گلیوما نقش دارد. سرکوب بیان ژن هدف بر پایه تداخل RNA (RNAi) ازطریق مولکول‌های RNA دورشته‌ای ازجمله siRNA می‌تواند به‌عنوان یک ابزار درمانی برای خاموشی انکوژن استفاده شود. هدف مطالعه حاضر، القای آپوپتوز در رده سلولی گلیومای U-87 با سرکوب ژن PTX3 است. مواد و روش‌ها: انواع روش‌های in silico برای طراحی siRNA در برابر ژن PTX3 استفاده شد، سپس امتیاز‌بندی طبق قوانین طراحی صورت گرفت. بهترین مولکول siRNA علیه ژن PTX3 انتخاب و همچنین siRNA درهم‌ریخته آن نیز طراحی و کارایی خاموش‌کردن PTX3 در سلول‌‌های U-87 توسط Real-time PCR ارزیابی شد. همچنین میزان مرگ سلول‌های ترنسفکت‌شده با گروه‌های کنترل توسط فلوسایتومتری مقایسه شد تا اثر کاهش بیان PTX3 بر آپوپتوز سلولی بررسی شود. نتایج: 53 مولکول PTX3-siRNA طراحی‌شده از جهات گوناگون، بررسی و امتیاز‌دهی و بهترین موارد جهت استفاده در تحقیقات سرکوب بیان ژن PTX3 پیشنهاد شدند. تیمار 72 ساعته سلول‌های U-87 با PTX3-siRNA طراحی‌شده در غلظت 100 نانومولار قادر به کاهش بیان PTX3 به میزان 69 درصد بود. نتایج فلوسایتومتری نیز نشانگر القای آپوپتوز در 65 درصد سلول‌‌ها بود. نتیجه‌گیری: کارآیی siRNA طراحی‌شده با روش in vitro تأیید شد که بر کاهش بیان ژن PTX3 و القای آپوپتوز در سلول‌های گلیوما U-87 تأثیر قابل‌ملاحظه‌ای داشت. M3 10.48307/FMSJ.2022.26.1.9 ER -